Le début de mission d’Amélie Kieffer aux Comores, a coïncidé avec l’émergence de la pandémie de Covid19. La Fondation a décidé, par sécurité, de rapatrier Amélie en France le 18 mars 2020, juste avant la fermeture des frontières.
Sa mission s’est poursuivie à distance avec un niveau d’implication soutenue jusqu’au mois de juin. Des mesures du Ministère de l’Europe et des Affaires Étrangères (MEAE) ne lui permettant pas de poursuivre sa mission à distance au-delà de 3 mois, son contrat a été mis en pause mi-juin. Une reprise de contrat et un retour sur le terrain étaient prévus pour début septembre.